車のエアコンの臭いの原因はカビや雑菌、タバコが主となります。それらが付着してエアコンのフィルターやエバポレーターなどから臭いが発生します。
エアコンのフィルターは基本的に数千円ほどで売っていますので、掃除よりも買って交換する方がオススメです。方法は助手席側のグローブボックスを外してフィルターの箱を引き出し、付け替えて戻せばOKです。ただ車によってフィルターの外し方は変わるので、説明書を読んで難しそうであればプロにお任せして下さい。
エバポレーターの掃除は専用の洗剤がいるのと、説明書を読みながら工夫もいる為、注意が必要です。
グッズに関してはスプレーや、フィルターにクリップで挟むタイプのカーエアコン用消臭抗菌剤があるので使うといいと思います。