どちらも軽自動車、年式も同等、距離もほぼ同じと言う事ですので、他で差を付けられる内容としてはグレードや装備、車の状態、修復歴、色や内装などの好み、今後の使い方ぐらいでしょうか。
まず大前提として、今後の使い方が重要になってくると思います。今後も結構乗る頻度が高くて沢山使っていきたい様でしたら状態の良い方を残す方がいいかと思いますし、逆にそんなに乗らなくてとりあえず足になればいいと言う事でしたら、両方買取の見積もりに出して高い方を売ると言う考え方もあります。
そこを決めた上で特殊なグレードやターボ付きかどうか、車検時に車の状態で注意店はあったかなど考えていくといいかと思います。ただおそらく大幅な買取額の差は無いかと思われますので、最終的には色やお好みで決めるのも間違いではないと思います。
ご参考になれば幸いです。